a::Send,a の様な設定をしてしまうと、出力のaをさらに解釈しようとして、無限ループに陥ってしまうことがあります これを避けるためには$を付けて $a::Send,a とすると、aをそのままaと解釈してaを出力します。また、 # UseHook を宣言することで、それ以降全て$をつけているのと同じ状態になります 敢えて外す必要が無い限り、取り敢えずファイルの先頭で宣言しておくと良いです

http://did2memo.net/2013/10/03/autohotkey-ctrl-key-is-stuck/
http://rcmdnk.github.io/blog/2013/07/28/computer-windows-autohotkey/
http://autohotkey.blog.fc2.com/blog-entry-60.html